Выше все верно написано. Подсумирую и дополню.
1) Самый «простой» вариант — это то, что предлагает фирма 1С. В типовые торговые решения встроен план обмена с сайтом, который выгружает в формате ComerceML данные по товарам, остаткам, резервам и (возможно) по взаиморасчетам. Из сайта загружаются заказы. Обмену штатными средствами задается расписание. По данной схеме работают Bitrix и еще несколько веб-магазинов.
2) Если есть возможность доработать конфигурацию, то можно реализовать и другие варианты выгрузки нужных данных. Можно поднять веб-сервисы. Если мне память не изменяет, то на дисках ИТС (которые дают в нагрузку ко всем продуктам 1С: Предприятие) есть пример двоих конфигураций, которые обмениваются заказами через веб-сервис.
3) Если есть возможность создать COM-объект 1С: Предприятия и доступны необходимые познания (или есть программисты), то можно создать (в рамках делигированных прав) все что угодно и получить всю необходимую информацию.
P.S. На структуру таблиц в СУБД лучше не ориентироваться, так как она не стабильна.