"- А куда ты хочешь попасть? - спросил Кот
- А все равно куда - ответила Алиса
- Ну тогда все равно куда и идти..." (С)
Если стоит конкретная задача - то и решайте ее в тех средствах, которые чаще всего используются для решения таких задач. У задачи всегда есть, например, бюджет. Не особо крупные конторы берут обычно в качестве роутера микротик, те ,что покрупнее - циску, идеология у них кстати очень похожа.
Если хотите просто поизучать, как настроить роутер на UNIX - можно и несколько вариантов попробовать. Проблема здесь не столько в том, чтобы попробовать, сколько в дальнейшей применимости знаний. Скажем, пересесть с FreeBSD на CentOS - довольно просто. А вот с CentOS на Gentoo - уже посложнее будет. Есть безусловно некий общий массив знаний, но программный роутер обычно строится на базе обычного дистриба - и тут выбор дистриба имеет существенное значение.