На самом гитхабе все описано.
Да и есть официальная документация
https://tech.yandex.ru/money/doc/dg/concepts/money...
1. На вашем сайте клиент выбирает оплатить через яндекс, например 100рублей
2. Вы создаете запрос с данными вашего приложения и правами например на единоразовое снятие с клиента средств в размере 100 руб и перенаправляете клиента на урл. (Вы можете например добавить еще и гет данные в запрос, которые вернутся к вам, например номер заказа и какую либо подпись, для того что бы индетифицировать заказ на своей стороне например, если у вас магазин)
3. Клиент переходит на сайт Яндексов, подтверждает что он разрешает вашему приложению снять 100руб и после этого Яндекс возвращает его на урл, который у вас прописан в настройках приложения, в гет запросе есть спец код и если вы добавляли, ваши дополнительные данные.
4. После прихода к вам с данными, вы запускаете выполнения снятия средств с кошелька клиента:
- Обмениваете код на токен
- С помощью токена создаете запрос на снятие средств
- Получаете ответ об успешном снятии, зачисляете заказ и сообщаете клиенту что все прошло успешно