BTW если ввести dataharbour.tk/installer/index.php?_step=3 оно у вас пишет что установщик запрещен. Так как оно закончит последний тест на логин если установщик уже запрещен.
Остываем и учимся читать собственные вопросы (да и ответы не нужно додумывать) - вопрос задан в общем - как мне открывать текстовые файлы созданные в виндоус в линукс? Ответ в точности отвечает на ваш вопрос. Уже созданный файл можно либо перекодировать, либо открыть в том же qedit сменив дефолтную кодировку на windows 1251.
Я в коде не делаю, я в php.ini выставляю нужные мне таймауты и время исполнения. Кроме того эти настройки должны коррелироват с настройками таймаутов самого apache.