При физическом доступе к телу компьютера защита тоже должна быть физической, например аппаратный шифровальщик дисков, аппаратное отключение (читай отрезание) портов. Все остальное от лукавого. Как попытка ватным (software) мешком забивать стальной (hardware) гвоздь.