1. Откройте исходный код страницы и посмотрите, есть ли там нужный файл.
2. Откройте панель Network в инструментах разработчика браузера и посмотрите, грузится ли нужный файл вообще.
Архитектуру стройте так, чтобы сократить нагрузку на диск. Кэшируйте всё и везде. Поставьте побольше памяти и всё будет хорошо.
1К пользователей это мало.
Зачем вам бэкап системы?
Можно ведь сделать бэкап конфигов и данных, а также списка пакетов.
При необходимости ставите систему с нуля, ставите пакеты по списку, возвращаете конфиги на места.
