Как редактировать Footer в самописной CMS?
Редактировать - это?
Поменять текст, поменять шаблон, добавить логику в шаблон?
Если коротко, смотрите на каком патерне построена CMS, если это MVC, то ищите шаблон отвечающий за отображение, какой нибудь footer.tpl\footer.php - и правите под своё усмотрение, перед этим сделав дубликат файла.
На будущее - лучше не связываться с самописными решениями, там с легкостью окажется неподдерживаемый велосипед.