Adamos

Новый ноут + старое ядро (Линукс старых версий) = геморрой.
Сейчас апрель 2022, уже вышла 22.04, зачем ставить новой системой 18.04?
Я не так давно с 20.04 маялся, пришлось локально выкачивать пакет драйвера со всеми зависимостями и подсовывать на флешке этому чуду без сетевой карты вообще, с одним вайфаем.

Новичок, не умеешь - ок.
Просто не создавай себе проблем сам, возьми дистрибутив посвежее.

Если не разбираетесь - не парьтесь и оставьте разметку по умолчанию.
HDD монтируется в /media и спокойно используется любыми приложениями так же, как в виндах диск D, например.
Если какие-то приложения хотят писать исключительно в домашнюю папку (как Стим, например), а вы против - можно сделать их папку симлинком на реальную папку на HDD, никаких проблем.
Выносить /home целиком на HDD глупо - многие программы хранят не только настройки, но и дисковый кэш в домашней папке, и быстрый доступ к нему критичен.

А кто вам сказал, что DE вообще как-то повлияет на работу конкретных программ?
Собственно, не считая маргинальщины, DE просто используют одну из двух графических библиотек - Qt или GTK.
Соответственно, в самом IDE, если его пилят не какие-нибудь мазохисты (из Canonical, например), есть настройки DPI экрана, которые применяются к самой библиотеке и воспринимаются всеми программами, ее использующими. Никто не мешает добавить в Xfce, основанный на Гноме, утилиту настройки Кед и указать в ней нужные DPI, чтобы Qt-программы тоже их учитывали.
Если же программа написана так, что про HiDPI ничего не знает и знать не желает - заставлять ее никто не будет и специально размазывать ее пикселы по экрану, насколько мне известно, тоже охотников нет.

В настройках виртуальной машины предлагается на выбор несколько графических драйверов. Стоит попробовать другие - глядишь, "кривое разрешение" перестанет быть помехой.