Вопрос разрешен. Техподдержка reg.ru оказалась компетентнее своих консультантов на горячей линии.
Мне основной www-домен создали как поддомен со своей папкой и ссылкой на эту папку, где я установил Wordpress и добавили две текстовые записи.
Остался на их бесплатных серверах ns1.reg.ru/ns2.reg.ru и ввел соответствующие записи:
Теперь и к cms есть доступ у хостера и основной домен ссылается на GitHub.
Спасибо за рекомендации
Виктор Таран и
Яков Светский