Например в RemoteDesktopManager в свойствах где есть вкладка "общие" > "после входа" вы можете задать команду. И когда вы подключаетесь к этой машине он выполняет эту команду что очень удобно. В mRemoteNG такого не нашел. Скрин добавил из RemoteDesktopManager. Может где то есть такая настройка?