Если у вас подобных сайтов немного, и они никогда не меняют IP-адреса (или делают это очень редко), можно прописать их в качестве статичных маршрутов через tun0.
Если доменов много, они периодически меняют IP-адреса, то один из вариантов — маршрутизация «по доменному имени». Это можно реализовать с помощью опции ipset в dnsmasq и маршрутизации адресов внутри ip set. Альтернативный вариант — сделать подобное на стороне сервера, по принципу
VPN АнтиЗапрета — маршрутизировать в VPN только одну подсеть, а на серверной стороне устанавливать маппинг адреса в эту подсеть для определенных доменов.