Есть варианты.
Например, пользователь был владельцем этого номера сколько-то лет назад, уже перестал им пользоваться, номер уже принадлежит новому владельцу, но Microsoft об этом ничего не знает.
Или номер был указан во времена, когда это не проверяли посредством SMS вообще, и может даже номер телефона был опциональным полем, которое спокойно можно было не заполнить или заполнить с ошибками. В конце концов, были времена, когда у Microsoft не было единого аккаунта, в разных базах могли быть самые разные данные, и при слиянии необязательный номер попало в обязательные.