Я на данный момент предложил бы самый дикий способ: переустановка. Если настройки в ручную не можете или не знаете как дефолтнуть, тогда через терминал
sudo apt-get autoremove gnome3;
#Gnome-shell заменить в зависимости от репозиториев
sudo apt-get install gnome-shell;