Как мне видится, единственная проблема может быть со скоростью. Если там будут только образы виртуалок, а обрабатываемые данные лежат в другом месте, то такое вполне допустимо. Если же критична скорость работы с диском, то Самба - далеко не лучшее место хранения образов.