Спасибо всем за то, что подсказали правильное направление. Настройки Wake Up лежат в операционке. В моём случае - Linux Mint.
Решается так (в моей конфигурации: USB-мышь, PS/2-клава).
Для мыши:
> lsusb -t
/: Bus 02.Port 1: Dev 1, Class=root_hub, Driver=xhci_hcd/6p, 10000M
/: Bus 01.Port 1: Dev 1, Class=root_hub, Driver=xhci_hcd/16p, 480M
|__ Port 10: Dev 2, If 0, Class=Human Interface Device, Driver=usbhid, 12M
|__ Port 10: Dev 2, If 1, Class=Human Interface Device, Driver=usbhid, 12M
$ sudo su
# echo disabled > /sys/bus/usb/devices/1-10/power/wakeup
Клаву нашёл так:
> cat /proc/acpi/wakeup
...
PS2K S4 *enabled pnp:00:01
...
# echo disabled > /sys/bus/pnp/devices/00:01/power/wakeup