1. Может ли ООО заключить со мной, как с физ-лицом, договор а оплату перечислять на другого человека с открытым ИП?
может.
2. Если ответ на п.1 утвердительный, то нужно как-то обозначать в договоре тот факт, что оплата будет другому лицу а не мне?
да, это надо указать в договоре или в дополнительном соглашении, или в заявлении.
PS Договор ГПХ не предлагать :-)
а никто и не предлагает. В п.1 вы заключаете договор ГПХ.
Но это всё равно Ваш доход. ООО должно удержать НДФЛ и перечислить страховые взносы. Для ИП будет доходом и надо заплатить дополнительно 6% (или сколько положено по его СНО). Или отбиваться и доказывать, что не его доход
Зачем Вы хотите перечислять ИП? Договор с физ.лицом не ИП, заключать можно. Если хотите обойти НДФЛ и взносы - я написала, это не лучший вариант.