Если файлы имеют названия вида image-000.tga, image-001.tga, ..., то:
В виде bat-файла с лежащим рядом ffmpeg-ом и изображениями в той же папке, либо через командную строку:
ffmpeg -framerate 25 -i image-%%03d.tga -pix_fmt yuv420p -vcodec libx264 -preset slow -crf 21 -r 25 -an file.mp4
Фреймрейт указывается дважды с помощью -framerate и -r, во избежание проблем также прописываем -pix_fmt yuv420p, если вдруг вам не нужен другой параметр (вы бы знали), -crf определяет качество, чем меньше цифра, тем лучше качество и больше размер файла.