Можно использовать редактор xls-файлов, который поддерживает регулярные выражения. Например, OpenOffice или LibreOffice. Microsoft Excel, насколько помню, не поддерживает.
Или новый Директ Коммандер.
Вам какой способ удобнее?
Переходите на вкладку с фразами. Можете обратить внимание, что на этой вкладке ключевые слова и минус-слова к ним находятся в разных столбцах. Чтобы скопировать все ключевые слова без минус-слов нажмите правой кнопкой мыши на заголовке столбца "Фраза" и выберите "Копировать".
Алексей Ларионов, а, так Вам просто удалить надо. Тогда зайдите в новом Директ Коммандере на вкладе Фразы в раздел "Редактировать" - "Заменить". В поле Искать замените "Искать" на "Все значения". В блоке Поля выберите только "Минус-фразы" и нажмите "Заменить все".
Алексей Ларионов, к сожалению, здесь невозможно добавлять второй ответ на вопрос. Но Вы можете отметить решением первоначальный ответ, в ветке которого содержится и полезный для Вас комментарий