Для этого существует масса инструментов и онлайн-сервисов. Каждый со своими "+" и "-". Мониторинг ссылок в Я.Вебмастер и Google Webmaster не даст полной информации, так как там учитываются только проиндексированные системой ссылки. Т.е ссылка может быть проиндексирована Яндексом и не проиндексирована Google. Сам пользуюсь профессиональным инструментом
Yazzle, так как он отображает сводную информацию по обратным ссылкам из многих поисковых систем. Кроме этого имеет достаточно много полезных «плюшек». Но, как все хорошее, эта программа стоит денег. Есть бесплатные аналоги. Самым достойным считаю BackLinks Master. Попробуйте, может Вам и подойдет.