Работаю в Linux Mint (Mate) с двумя мониторами. Никаких проблем.
Раньше работал в Ubuntu, тоже всё работало прекрасно.
Вообще, с NVidia проблем не будет, выбирайте любой по вкусу.
Наверно тут дело не в линуксе а в иксах, я на работе сижу на fedora 19 c 3-м гномом на 2-х мониторах, никаких глюков, все работает идеально. Видео правда не Nvidia а Radeon.
Про дистрибутивы всё уже сказали, а так:
Советую обратить внимание на тайловые оконные менеджеры (Awesome, xmonad, etc..). Весьма удобные и функциональные вещи.
Я так понимаю это замена GNOME, просто не сидел до этого на линуксе. Если я поставлю замену гному, то проблем с двумя мониторами не будет в плане распределения иконок по мониторам?
Это не то чтобы замена, эта альтернатива классическим оконным менеджерам(Gnome, KDE, LXDE).
Проблем там не будет как с иконками на рабочем столе, так и с фиксацией приложений к определённым частям экрана выбранного монитора.
Советую посмотреть данные менеджеры путём запуска лайв-сиди с данным оконным менеджером, дабы понять основные фишки данного направления. Всё-таки не каждому такой вариант по вкусу.
В случае с карточками AMD - практически любой с апдейтом до ядра 3.13, в котором, наконец, умудрились сделать нормальную поддержку двух мониторов. В случае с Nvidia - просто Kernel Mode Streaming и накаких проблем. Советую из личного опыта. Что касается разработки - перепробовал многое и остался на Ubuntu.
