ИМХО только руками.
DHCP точно вручную придется переносить. Если есть статика то заводить все заново, если нет статики, то не смысла переживать, новый IP раздадутся автоматически.
DNS - можно попробовать настроить как SLAVE, чтоб он подсосал настройки с микротика, НО! Я бы рекомендовал тоже настроить все заново. Все таки CD не любит такие фокусы и DNS на нем должен быть primary.
Не думаю что у вас там 100500 записей в DNS. И вполне можно все забить вручную