Судя по описаниям - можно M.2. Здесь есть перечень конфигураций, среди которых есть конфигурация с двумя дисками:
Игровой ноутбук Lenovo Legion Y520. А здесь есть фотографии внутренностей (Раздел "Обслуживание"), на которых HDD и M.2 диски:
Обзор игрового ноутбука Lenovo Legion Y520 15IKBN
Но 100% гарантию только собственные глаза дадут. Мало ли, может в модели с HDD на разъёме M.2 сэкономили! Но это маловероятно, скорее всего всё на месте. Можете попробовать ещё в техподдержке Lenovo уточнить.