Очень просто.
Регистрируете сайты в Яндекс справочнике и указываете адрес организации. Кстати, не забудьте полностью заполнить профиль организации, это важно.
В Яндекс вебмастере указываете региональную принадлежность каждого сайта и проблема решена.
Видеоинструкция по добавлению в справочник
тут.
Что касается Google, то здесь нет соответствующего раздела в Search Console (есть но указать можно только страну). Поэтому регион нужно указать в
Google Business. Также старайтесь на 100% заполнять профиль, это важно в продвижении и отображении на картах.
Кстати, почитать о том как высчитывается рейтинг организации в справочнике можно почитать в
блоге яндекса.