без плагинов
Меня всегда улыбает, когда люди пишут эту фразу...
Плагины в WP - это просто куски кода. Тот же код в плагине или в functions.php делает ровно то же самое. Единственное исключение - это если плагин еще предоставляет страницу настроек, а вам она не нужна - тогда качаете плагин, открываете код и копируете оттуда ровно то, что вам надо. В общем, вопрос не в том, использовать плагин или нет, вопрос исключительно в том, насколько хорош его код. То же касается и "код в functions.php" - туда тоже можно впихнуть какую-то гадость.
А теперь конкретно по вопросу комментов: Устанавливаете плагин
Disable Comments и закрываете вопрос раз и навсегда.
Если прям совсем мешает лишний плагин в списке - открываете его код, удаляете все лишнее, оставшееся копируете куда там вам удобнее и используете в таком виде. Но я не вижу совершенно никакого смысла в этом (а я фанат производительности и вырезания лишнего кода), в данном случае плагин решает вопрос максимально эффективно.