В бесплатной лицензии отключен Backup API, поэтому большинство нормальных бэкаперов не смогут ничего сделать.
Но варианты есть, например в интернете ходит скрипт с помощью которого можно бэкапить виртуалки (гуглите профильные сайты). Так же у Veam есть продукт, который позволяет делать бэкапы по SCP.
Точных названий уже не помню, сам пользовался Symantec BackupExec, но у меня и ESXi был не бесплатный.
PS: Вообще BackupAPI удобная штука. У VMWare есть утилиты, с помощью которых можно монтировать диск стораджа ESXi к винде (сторадж должен быть доступе в винде по SAN) и просто копировать файлы снапшота ВМ. Для создания снапшотов так же есть утилита. Подробностей уже не помню, т.к. тренировался я еще на версии ESXi 4.0. Но все было взято из родного мануала по бэкапам.
