Во-первых, зависит от того, что вы собираетесь восстанавливать. Если это файлы шаблона, то проблем быть не должно.
Во-вторых вы можете смержить 2 базы (но это уже требует какого-то навыка), за подробностями можете обратиться к гуглу
раз и
два.
В-третьих желательно производить все манипуляции на локальном сервере или если такой возможности нет, обязательно сделать бекап (хотя его стоит сделать в любом случае перед какими-либо манипуляциями)