Нет вы не правильно понимаете, выгрузка из 1с приходит в виде xml файлов, товаров и предложений кним, плюс картинки, плюс хайлоады.
Все это гадство грузится в табличку xml_tree и от туда уже загружается.
После этого идет постобработчик, дорабативает структуру до нужной вам ( желательно все это делать в 1с)
Если обмен инкрементный то немного сложней, отслеживается разница изменений.
Но существуют такие звери "рукожопы" которые думают что они умней всех и они начинают пилить свой (ПРАВИЛЬНЫЙ) блэкджек со шлюхами.
У вас может быть как первый вариант так и второй
1. вы не правильно разобрались в загрузке.
2. Вам не позавидуешь , поскольку есть куча полностью написанный с нуля обмен или сильно закостомленый, вам никто не прокоментирует и не скажет как он работает, порой они работают уж совсем по идиотски.