Если хочешь простой вариант - измени тему на "применение средств криптографии для защиты данных в современных информационных системах" и напиши аналог TrueCrypt (шифруй какие-нибудь файлы на своем диске). Если хочешь сложностей - лучше посоветуйся с преподавателем, сложностей миллионы. Первое пришедшее в голову - реализуй передачу зашифрованных данных с использованием ЭЦП (на своем компе зашифровал, на другом компе подтвердил с помощью ЭЦП что ты - это ты и расшифровал).
Ещё можно что-нибудь со стеганографией написать - тема интересная и обширная, но придется в корне менять тему диплома)