Если просто добавляется расширение .jpg, и есть возможность загружать картинки в других форматах, то это, конечно, не правильно.
Если все файлы действительно конвертируются в jpeg, или загрузка файлов в других форматах фильтруется где-то, то всё ок.
Ну и да, расширение, не имеет отношения к _формату файла_, на самом деле. Это не более чем подсказка.