Все зависит от того, ведете ли вы бизнес на территории РФ (т.е. являетесь ли вы налоговым резидентом). Если налоговая сможет доказать, что фактически бизнес ведется здесь (т.е. зарегистрировано ООО, есть офис на территории РФ) и извлекается прибыль, то могут усмотреть в этом нарушение, и оштрафовать (в том числе и за неисполнение требований ФЗ-54). В случае, если бизнеса здесь де-юре и де-факто нет, то и опасаться нечего.
Другой вопрос в том, как именно вы видите эту ситуацию. Например я работаю в белую, официально, касса у меня есть (учитывая, что с сайта платежей у меня нет). Если бы были платежи на сайте, я бы использовал Яндекс.Кассу (которая интегрируется с моей физической кассой без проблем).
Будут вопросы — пишите.