Может, моё мнение предвзято, но я очень скептично отношусь к PyPy, IronPython, Jython и подобным проектам. Поддерживаются старые версии языка, слишком непопулярны, непонятная совместимость с библиотеками и прочее отталкивает.
Тебе питон либо нужен, либо нет. Наверное, в 99% случаях если тебе нужна скорость от питона и это не работа с numpy/skilearn — ты выбрал не тот язык. А в остальных 1% случаях ты можешь либо поменять язык, либо вынести ЦП-затратную логику в Си-экстеншн. А его писать либо на Си, либо на Cython.
Собственно, если ты уверен, что язык ты выбрал тот — попробуй Cython.