Плюсы агрегаторов:
- обычно проще технические и юридически
- несколько способов оплаты сразу
- Быстрое подключение
Минусы
- Как правило выше комиссия
Еще бывают различия в возможностях, связаны как правило с приемом карт:
- возврат платежей
- HOLD (блокировка) денег на карте и последующее полное или частичное списание денег с карты или полный возврат суммы
- отключение проверки 3ds для карт (sms подтверждение от банка)
- Оплата через всплывающее окно у вас на сайте без переадрессации на сайт системы
- Списание в иностранной валюте
- прием зарубежных карт American Express, Discover и др
- Привязка карты и повторные платежи в 1 клик
- Привязка карты и регулярные автоматические платежи, например раз в месяц
На начальном этапе когда оборот маленький важна возможность приема оплаты и удобство для плательщика и конверсия , а не комиссия платежных системы.
Поэтому первым этапом подключаем агрегатор, например Яндекс кассу,
потом подключаем эквайринг для карта от банка, например Тинькофф ,
а затем Paypal для зарубежных клиентов.
В целом все зависит, от таких параметров как: средний чек, ежемесячный оборот, за что принимаем оплату, страны покупателей.