Статус письма "Получено / Не получено" обычно хранится на почтовом сервере, причём не в письме, а в индексном файле или БД. Поэтому при переносе почты на другой сервер надо переносить эту информацию отдельно.
И ещё, рекомендую обратить внимание, у некоторых пользователей MS Outlook, возможно, включена функция "Автоматически отправлять отчёт о прочтении" при получении письма. Т.е. пользователь получивший несколько тысяч новых писем и нажавший "Отметить папку как прочитанную" отправит этот отчёт всем, кто его когда-либо просил. Я на таком обжёгся один раз.