Есть утилита dd, позволяет клонировать как диски целиком, так и отдельные разделы. Загружаешся с LiveCD и ей переносишь данные, ну а далее, если есть разделы с ext4, им надо в /etc/fstab добавить в список опций discard, чтобы включить команду Trim.
Если разделы разного размера, то имхо быстрее и проще опять же загрузится с LiveCD, на SSD создать нужные разделы, отформатировать их (командой mkfs, например mkfs.ext4 /dev/sdb1 - создаст файловую систему ext4 на разделе /dev/sdb1), и дальше просто перекопировать файлы. Например, /dev/sda жесткий диск, /dev/sdb - новый ssd. Тогда принцип примерно такой:
mkfs.ext4 /dev/sdb1 - создали файловую систему
tune2fs -m 0 - это отключит резервирование места для root, эту команду можно делать на всех разделах кроме системного, особенно если логи пишутся на него же (а обычно так и есть)
mount /dev/sda1 /mnt - монтируем раздел с hdd в папку /mnt, её заранее надо создать командой mkdir /mnt
mount /dev/sdb1 /new - монтируем раздел с ssd в папку /new
cp -a /mnt /new - копируем все файлы с сохранением аттрибутов, прав и т.д.
И так со всеми нужными разделами. Потом надо подмонтировать куда-нибудь корневой раздел, например в папку /mnt, и сделать chroot /mnt - этим переключишся в свою систему на SSD, и сделать grub-install - это пропишет загрузчик на SSD.
