Частота опроса - это характеристика мыши, регулируемая (если возможно) в драйверах. Windows сам по себе не может влиять на это.
Возможно, у вас включена акселерация (галочка "Включить повышенную точность указателя" в свойствах мышей) и вы её спутали с плавающим CPI.