Вы подходите к проблеме не с той стороны. Консоль - всего лишь один из видов пользовательского интерфейса. Системная безопасность не должна опираться на доступность определенных элементов в пользовательском интерфейсе. Все что юзер может натворить, имея доступ к консоле, он может натворить и без нее (допустим, при соответствующей фазе луны, но все же).
Гораздо надежнее будет заблокировать конкретно те операции, которые юзер не должен иметь возможность совершить, имея доступ к консоле.