Можно запаковать текстуры в сам бленд файл.
File > External Data > Pack All into .blend
Тогда Блендер будет читать текстуры прямо из бленд файла. Размер файла при этом вырастет, конечно.
Но не знаю, как это будет работать в случае с запеканием.
Еще вариант попробовать поменять пути с абсолютных на относительные. Т.е. все пути будут задaваться относительно бленд файла. Я обычно пользусь этим методом.
File > External Data > Make All Paths Relative