Попробуйте создать .bat-файл с таким содержимым:
SET DIRECTORY_NAME="C:\Windows"
TAKEOWN /f %DIRECTORY_NAME% /r /d y
ICACLS %DIRECTORY_NAME% /reset /T
PAUSE
И запустите его через командную строку. Но делайте это на свой страх и риск. Я не отвечаю за последствия )