Вообще вопрос не в ту степь.
Все зависит от того чем пользоваться: какой язык, какой пакетный манагер.
src - сокращение от source, т.е. исходники.
как правило так.
Но прописать можно откуда угодно, для конечного пользователя это роли не играет, если это самостоятельный компонент/библиотека, которые подключаются в сборщик/автозагрузчик.
Пакеты подгружаются автоматически по конфигу пакетного манагера, руками полные пути никто не пишет.
В общем без конкретного указания языка/пакетного менеджера этот вопрос не имеет смысла.
К Githubу это вопрос вообще никак не относится. Гитхаб просто хранилище, которое может быть любым, и к языку не привязано и к исходникам.