Когда как.
Есть ресурсы времени, финансы - сделай отдельный мобильный дизайн. Нет - оставь мобильную версию сайта.
Посмотри на гугл, внедряющий material design в ios-систему, или кроссплатформенные мобильные приложения (навскидку - ticktick, wunderlist, asana, - поищи, много их).
Можно умудриться и сделать дизайн, соответсвующий гайдлайнам и iOS, и Android.