Если Вы ничего не делаете через админку, то смысл вообще в CMS? Только название поменять сайту?
1) Не важно откуда подключать файлы: с wp-includes или другого места, для индексации это не важно. То есть без разницы, подключите Вы jQuery из wp-includes или с google cdn подтяните
2) Если у Вас создана 1 страница и более вообще ничего, то и запрещать в robots.txt нечего. Единственное, я бы запретил архивы автора (или вообще отключил). Это всё легко делается плагином
Yoast SEO, не нужно будет лазить по файлам.
3) Нет никакого смысла запрещать css и js, нет никого смысла в этом. Зачем? Если их запретить, то Гугл (и скорее всего Яндекс) не поймёт, что у Вас адаптивная вёрстка, если все media queries хранятся в css файлах.
4) Нужно запрещать только дубли контента и информации, которую Вы не хотите видеть в поиске. В Вашем случае, у Вас всего лишь 1 страница. Нет повода что-либо запрещать, кроме страницы автора (Вас), так как Вы создаёте 1 страницу и сразу же автоматом создаётся архив автора, а также архив по датам. Всё это можно отключить плагином, ссылку на который я дал выше. Ну или же прописать это в robots.txt. Но я бы выбрал плагин, потому что он добавляет мета-теги на страницу, а они приоритетнее правил robots (так говорят сео мастера).