1. Платные доп услуги. Проще, заплатить, чем переехать если оперативы не хватает или места на диске.
2. Реклама от google/yandex
3. Партнерские программы с платными cms. Например, webasyst - партнерская скидка до 50%, а это 10k рублей. Если сделать кнопку "установка магазина в 1 клик" - можно продавать лицензии. Мало того так как часто сайты помирают на 2-3 месяц существования, можно продавать повторно. Уверен, что и bitrix и других есть подобные партнерки.
4. Продажа других товаров. Например, "настройка под ключ удаленного рабочего стола с 1c", "простой landing page за 10k" и т.д.