В том и дело, что есть единый API.
1. Платёжная система. Если это перевод по номеру карты (card-to-card переводы в Visa, MasterCard, МИР) или перевод по номеру телефона СБП.
2. SWIFT, CIPS, СПФС и другие системы для обмена данными, если это перевод по банковским реквизитам.
3. Если нужно больше, чем перевод - есть "открытый банкинг", но он пока в весьма зачаточном состоянии. Вроде только между себром и тбанком сейчас есть (и то не уверен, через него работает или у них там свой протокол)
А сами деньги двигаются через корреспонденские счета.