Склейка редиректом является корректным методом.
Однако, на практике, сейчас быстрее выходить склеивать через Host + указание главного зеркала в "Яндекс.Вебмастере".
Алгоритм следующий:
1. Оба сайта (старый и новый протокол) должны быть доступны, редиректов быть не должно.
2. На оба прописываете Host:
https://site.ru
3. Подтверждаете права на сайт в "Яндекс.Вебмастере", подаёте заявку на склейку.
4. Через 2-3 апдейта зеркала будут склеены, тогда можно будет со спокойной душой поставить редирект.
В вашем же случае, возможно, целесообразнее уже не убирать редирект и дожидаться склейки по редиректу.