./ в nix-системах адрес текущего каталога, т.е. ты сообщаешь серверу, что искать надо файл именно в этом каталоге, а не в том, который определяется в base
В случае если указан <base href="..."/>
путь будет указываться от base-href'a, ну и все зависит от настроек сервера.
Да и выглядит так симпатичнее, как по мне ^^