Может быть UserAgent?
Также попробовал сохранить куки с локально установленного phpMyAdmin. Строчка в файле, сохраненном wget, выглядит так:
127.0.0.1 FALSE /pma/ FALSE 1294809105 pma_theme original
А curl — так:
#HttpOnly_127.0.0.1 FALSE /pma/ FALSE 1294809043 pma_theme original
В целом, это Netscape HTTP Cookie File, но меня смущает комментарий в начале строки, который ставит curl.