если вы используете двухуровневые конструкции типа
RewriteCond %{REQUEST_URI} ^(.*)/{2,}(.*)$
RewriteRule . %1/%2 [R=301,L]
то разницы нет никакой.
А вот если вы делаете просто
RewriteRule catalog$
http://site.ru/goods[R=301,L]
RewriteRule catalog/tovar3.html$
http://site.ru/goods/tovar/tovar3[R=301,L]
то в таком случае редирект каталога должен стоять после редиректов всех внутри него.