Объяснение
Когда делаешь
class Application(Frame):
то Application - это твой самодельный класс, который делается из существующего класса Frame.
Это значит, что все объекты (экземпляры) класса Application будут двух типов одновременно - типа Application и типа Frame.
Когда делаешь
def __init__(self, master):
это значит, что ты у класса Application делаешь метод __init__. При этом у класса Frame есть свой собственный метод __init__. Эти методы могут полностью различаться.
Когда делаешь
app = Application(root)
ты создаёшь объект (экземпляр) класса Application. При этом ему в метод __init__ передаётся основное окно всей программы.
app имеет сразу два типа - самодельный Application (который ты сам сделал) и существующий Frame (который уже сделали до тебя). По правилам tkinter'а, когда ты создаёшь какое-нибудь окно, его надо прилеплять к основному (так можно давать команды сразу всему дереву окон, в котором одни окна прилеплены к другим, и всё это прилеплено к основному окну).
Так вот, чтобы было всё правильно, твой самодельный объект, который сделан из существущего оконного типа, нужно прилепить к основному окну. Но так как твой объект - самодельный и сам по себе окном не является, то внутри себя он должен обратиться к тому типу, который делает его окном, и передать ему основное окно программы, чтобы тот мог к нему прилепиться.
Понимаешь, у тебя app - это один объект как бы двух типов: один тип не делает ничего, в нём есть только свой __init__ и ещё там какой-то самодельный метод; а другой тип является окном со всеми методами и свойствами окна.
Поэтому, чтобы в своём самодельном типе что-то делать, ты обращается просто к его элементам. А чтобы в существующем типе что-то делать, ты к нему получаешь доступ через super() (от слова суперкласс), а потом обращаешься к своим же элементам но через методы другого типа.
Поэтому запись
super(Application, self).__init__(master)
Означает, что нужно взять метод __init__ у базового класса Frame и передать в него аргумент master, переданный в __init__ производного класса Application.
Функция super() как бы отыскивает базовый класс у класса Application и возвращает его, а дальше уже идёт обращение к методу __init__ этого найденного класса.