Магистратура - не тот уровень, чтобы там преподавать настолько прикладное направление. Посмотрел бегло направления в магистратуре ВШЭ - ничего связанного с мобильной разработкой не нашел.
По моему, самое перспективное направление для обучения в плане развития как разработчика и тим-лида/тех-лида - это программная инженерия (в профиль можно не идти, я по учусь по этому направлению). Но тут надо смотреть конкретную программу обучения конкретного вуза - везде учат тому, что считают нужным, и это не всегда согласуется с реальными потребностями как рынка, так и твоими, когда ты будешь дальше работать по этому направлению. Поэтому никто и никогда не отменяет самообразование и саморазвитие.
По программной инженерии точно есть магистратура в ИТМО потому, что там бакалавров по этому направлению учат.