Если вопрос про обфускацию имен классов и идентификаторов, то это решает htmlmuncher. Гугловый closure templates тоже умеет компилироваться с рандомными именами.
Если вопрос про защиту от копирования, то во-первых, это бессмысленно, во-вторых - невозможно.
Flash способен дать нечто похожее на защиту. Тем более, он поддерживает левые протоколы вроде RTMP, с которыми без поллитру не разобраться. А вообще, если так надо защитить, то надо писать свой закрытый клиент, вплоть до совсем редкого или вовсе своего протокола, вроде как у Skype, и чтобы в открытом доступе его не было, а то отреверсинжинирим.
